Nie tylko nowoczesne szpitale i kuracje antybiotykowe są odpowiedzialne za pojawienie się lekoopornych szczepów bakterii. Najnowsze badanie wykazało, że na pojawienie się niektórych opornych bakterii miała wpływ naturalna presja selekcyjna.

Korzystając z technologii analizy i sekwencjonowania, naukowcy stworzyli wykres ewolucji bakterii Enterococcusfaecalis. Jest to pospolita bakteria, u której może rozwinąć się oporność na antybiotyki. Innym przykładem zakażenia szpitalnego opornego na antybiotyki jest oporny na metycylinęStaphylococcusaureus.

Wyniki opublikowane w Nature Communications pokazują, że ta bakteria E. faecalis ma zdolność bardzo szybkiego przystosowywania się do presji selekcyjnej. Na przykład stosowanie chemikaliów w rolnictwie, a także opracowywanie nowych leków, które spowodowały pojawienie się różnych szczepów tej samej bakterii.

Ze względu na jej powszechną dystrybucję naukowcy sugerują testowanie ludzi na obecność tego typu bakterii po przyjęciu do szpitala w taki sam sposób, jak w przypadku innych superbakterii. Celem jest zmniejszenie prawdopodobieństwa rozwoju i rozprzestrzeniania się infekcji w systemie opieki zdrowotnej.

Enterococcusfaecalis to pospolita bakteria występująca u większości ludzi w przewodzie pokarmowym i nie szkodzi gospodarzowi. Jednak osłabienie odporności i przedostanie się do krwiobiegu może spowodować poważne komplikacje.

Odporne na antybiotyki szczepy E. faecalis są bardziej powszechne w szpitalach i początkowo sądzono, że powszechne stosowanie antybiotyków i innych środków kontrolnych w nowoczesnych szpitalach doprowadziło do rozwoju tych szczepów.

W ramach najnowszych badań naukowcy z Wellcome SangerInstitute, University of Oslo i University of Cambridge przeanalizowali około 2 tys. okazów E. faecalis od 1936 do chwili obecnej. Eksperci użyli izolatów krwi pochodzących od pacjentów oraz próbek kału zwierząt i zdrowych ludzi. Korzystając z sekwencjonowania genomu (w tym chromosomów i plazmidów) z wykorzystaniem technologii Oxford Nanopore, zespół zmapował ścieżkę ewolucyjną bakterii. Ponadto specjaliści stworzyli oś czasu i mapę rozwoju różnych jej odmian. W tym te, które są obecnie rozpoznawane jako oporne na antybiotyki.

Okazało się, że oporne szczepy pojawiły się wcześniej, niż sądzili naukowcy. Stało się to przed powszechnym stosowaniem antybiotyków. Naukowcy odkryli, że rolnictwo i wczesne praktyki medyczne, takie jak stosowanie arsenu i rtęci, wpłynęły na ewolucję niektórych szczepów. Oprócz tego u dzikich ptaków znaleziono szczepy podobne do odmian odpornych na antybiotyki, które obecnie zagrażają szpitalom. Badanie wykazało, jak skutecznie ten typ bakterii przystosowuje się i łatwo przekształca w nowe szczepy.